とある田舎で学園生活を送る主人公「宗介」は
父親の再婚により幼少期以降、一緒に暮らす義妹の「七瑠」
幼馴染の「真帆」たちと
学園のオタク部（通称B研）で、愉快なオタクライフを満喫していた。
穏やかな毎日……しかし、
夏休みまで後ひと月に迫ったある日、事件が起きる。
「ずっと会いたかったよ……兄さん！！」
母親に引き取られ、幼少期まで一緒に暮らしていた
実妹「すず」が、なんと帰ってきたのだ！
学園で、家で、外で、実の妹パワーを静かに振りかざす実妹、
ただひたすら気まずい義妹。
義妹「今さら妹とか言われてもーこいつ（兄）はもう調教済みだしーゲヘヘ」
実妹「じゃあ、調教し直すから」
ヤバイ。
俺のヤバイ妹達。
それだけでもピンチな状況なのに、
無理やり一目惚れしてきた先輩「志衣菜」が現れ、
幼馴染「真帆」の様子もなんか変だ。
どうする、どうなるこの状況！！